Genomsequenzierung/ genomic sequencing
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Insbesondere wenn bei immunsupprimierten Impf-Non-Respondern eine SARS-Cov_2 Infektion festgestellt wird, sollte direkt eine Genomsequenzierung erfolgen. Die sollte der behandelnde Arzte direkt veranlassen!
Zum einen um therapeutisch entscheiden zu können ob/ welche monoklonalen Antikörper zur Behandlung in Frage kommen.
Zum anderen um festzustellen, ob es z.B. durch den Einsatz von Medikamenten (u.a. Remdesivir usw.) zu Mutationen bei dem nicht immunkompetenten Patienten kommt.
Auch können immunsupprimierte Patienten nach Behandlung zwischenzeitlich negativ getestet werden - und sie werden später doch wieder positiv getestet, wobei es zu keiner neuen Ansteckung gekommen ist, sondern es sich noch um Folgen der früheren Infektion handelt.
Quellen (52)
Markiert sind besonders wichtige Quellen.
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SARS-CoV-2 Evolution and Immune Escape in Immunocompromised Patients
nejm.org, hinzugefügt am 24.06.2022, wichtige Quelle
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Triple combination therapy with two antivirals and monoclonal antibodies for persistent or relapsed SARS-CoV-2 infection in immunocompromised patients
academic.oup.com, hinzugefügt am 10.04.2023
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Surveillanceverordnung: Mehr Sequenzierungen, weniger Geld
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 24.06.2022
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Intrahost evolution and forward transmission of a novel SARS-CoV-2 Omicron 2 BA.1 subvariant
medrxiv.org, hinzugefügt am 06.06.2022
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Persistent SARS-CoV-2 Alpha Variant Infection in Immunosuppressed Patient, France, February 2022
wwwnc.cdc.gov, hinzugefügt am 09.05.2022
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Monitoring and managing SARS-CoV-2 evolution in immunocompromised populations
thelancet.com, hinzugefügt am 18.03.2022
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Coronavirus-Genom-Sequenzierung an der Universitätsmedizin Mainz
unimedizin-mainz.de, hinzugefügt am 06.03.2022
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SARS-CoV-2’s high rate of genetic mutation under immune selective pressure: from oropharyngeal B.1.1.7 to intrapulmonary B.1.533 in a post-vaccine patient
ijidonline.com, hinzugefügt am 06.03.2022
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Sample Size Calculations for Variant Surveillance in the Presence of Biological and Systematic Biases
medrxiv.org, hinzugefügt am 10.01.2022
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Rapid incidence estimation from SARS-CoV-2 genomes reveals decreased case detection in Europe during summer 2020
nature.com, hinzugefügt am 20.10.2021
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COVID-19, the first pandemic in the post-genomic era
sciencedirect.com, hinzugefügt am 06.08.2021
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Comprehensive analysis of RNA-seq and whole genome sequencing data reveals no evidence for SARS-CoV-2 integrating into host genome
biorxiv.org, hinzugefügt am 09.06.2021
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India’s neighbours race to sequence genomes as COVID surges
nature.com, hinzugefügt am 17.05.2021
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Coming to America: Genomic surveillance and how B.1.1.7 arrived in the US
cell.com, hinzugefügt am 15.05.2021
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Coming to America: Genomic surveillance and how B.1.1.7 arrived in the US
cell.com, hinzugefügt am 15.05.2021
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Multiplex qPCR discriminates variants of concern to enhance global surveillance of SARS-CoV-2
journals.plos.org, hinzugefügt am 11.05.2021
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One million coronavirus sequences: popular genome site hits mega milestone
nature.com, hinzugefügt am 24.04.2021
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Why US coronavirus tracking can’t keep up with concerning variants
nature.com, hinzugefügt am 17.04.2021
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High-throughput, single-copy sequencing reveals SARS-CoV-2 spike variants coincident with mounting humoral immunity during acute COVID-19
journals.plos.org, hinzugefügt am 09.04.2021
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Scientists can now sequence an entire genome overnight.
nytimes.com, hinzugefügt am 02.04.2021
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Simultaneous Detection and Mutation Surveillance of SARS-CoV-2 and co-infections of multiple respiratory viruses by Rapid field-deployable sequencing
cell.com, hinzugefügt am 01.04.2021
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How the US Failed to Prioritize SARS-CoV-2 Variant Surveillance
jamanetwork.com, hinzugefügt am 25.03.2021
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Rapid identification and tracking of SARS-CoV-2 variants of concern
thelancet.com, hinzugefügt am 23.03.2021
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Phylogenomic tracing of asymptomatic transmission in a COVID-19 outbreak
cell.com, hinzugefügt am 23.03.2021
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Groundbreaking new technology to detect known variants of concern
gov.uk, hinzugefügt am 22.03.2021
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http://www.uniindia.com/~/rt-pcr-test-can-miss-new-covid-19-variants-dak/States/news/2335428.html
uniindia.com, hinzugefügt am 06.03.2021
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US Boosts Virus Sequencing Efforts as More Variants Emerge
medscape.com, hinzugefügt am 05.03.2021
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B.1.1.7 in 46 Prozent der positiven Proben
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 05.03.2021
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SARS-CoV-2-Genomanalysen: Fehlende Metadaten aus Deutschland behindern internationale Forschung
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 27.02.2021
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Report Outlines Strategy for Surveillance of Emerging Coronavirus Variants
jamanetwork.com, hinzugefügt am 25.02.2021
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Baden-Württemberg baut Kapazitäten zur Analyse von Virusvarianten aus
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 16.02.2021
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Niedergelassene Ärzte können Analyse der SARS-CoV-2-Virusvariante veranlassen
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 10.02.2021
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Genomic sequencing in pandemics
thelancet.com, hinzugefügt am 06.02.2021
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UK to support rest of the world to find COVID-19 virus variants
gov.uk, hinzugefügt am 01.02.2021
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Verteilung der Coronavirusvarianten in Deutschland weiter unklar
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 31.01.2021
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RKI nennt Kriterien zur Probenauswahl für die Coronasequenzierung
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 27.01.2021
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Corona-Sequenzierung Wie Island die Mutanten überwacht
spiegel.de, hinzugefügt am 22.01.2021
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Labore bekommen 220 Euro pro Vollgenomsequenzierung
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 19.01.2021
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Alarming COVID variants show vital role of genomic surveillance
nature.com, hinzugefügt am 17.01.2021
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Spahn: Zu wenige Laboruntersuchungen auf neue Coronavarianten
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 15.01.2021
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Qiagen warns against using standard tests to track coronavirus variants
reuters.com, hinzugefügt am 15.01.2021
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Spahn: Zu wenige Tests auf Corona-Varianten
n-tv.de, hinzugefügt am 14.01.2021
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Labore bereiten sich auf Sequenzierungen vor
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 13.01.2021
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Südafrika-Variante des Coronavirus in Deutschland entdeckt
sueddeutsche.de, hinzugefügt am 12.01.2021
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Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings
virological.org, hinzugefügt am 12.01.2021
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Dramatic increase in the SARS-CoV-2 mutation rate and low mortality rate during the 4 second epidemic in summer in Marseille
mediterranee-infection.com, hinzugefügt am 12.01.2021
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SARS-CoV-2: Genom-Sequenzierung wird ausgeweitet
aerzteblatt.de, hinzugefügt am 12.01.2021
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Large-scale genome sequencing shows how SARS-CoV-2 mutated
news-medical.net, hinzugefügt am 11.01.2021
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Genomic epidemiology of novel coronavirus - Global subsampling
nextstrain.org, hinzugefügt am 23.12.2020
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Genomic epidemiology of hCoV-19
gisaid.org, hinzugefügt am 23.12.2020
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Covid: New variant found ‘due to hard work of UK scientists’
bbc.com, hinzugefügt am 23.12.2020
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How Iceland hammered COVID with science
nature.com, hinzugefügt am 27.11.2020